Bölgesel Amatör Lig'in 12 grupta tamamlanmasının ardından toplam 63 baraj müsabakası oynandı. Bu müsabakaların 35'ini BAL takımları kazanırken 28'ini yerel amatör lig takımları kazanarak 2016-2017 sezonunda BAL'da oynama hakkını kazandı.
11'i Spor Toto 3.Lig'den düşen takımlar, 46'sı 2015-2016 Sezonunda BAL'da direk kalan, 35'i BAL'da olupta baraj müsabakasında ligde kalmayı başaran, 28'i yerel amatör lig takımı olup baraj müsabakasını kazanarak BAL'a çıkan, 45'i yerel amatör ligden direk BAL'a çıkan takım olmak üzere toplam 165 takım 2016-2017 sezonunda Bölgesel Amatör Lig'e katılma hakkı elde etti.
Diyarbakır’dan Bağlar Belediyespor ile Yolspor BAL liginde kentlerini temsil edecekler.